Ichigo Kurosaki dan Rukia Kuchiki adalah Soul Reapers, tentara yang dipercaya dengan mengantarkan jiwa-jiwa orang mati dari Dunia Hidup ke alam akhirat yang dikenal sebagai Soul Society dan dengan pertempuran Hollows, jiwa-jiwa yang tersesat hebat yang dapat membahayakan baik hantu maupun manusia. Setelah mengalahkan Hollow di sebuah taman lokal, roh-roh seperti hantu yang tidak dikenal mulai muncul, sebelum seorang Soul Reaper misterius bernama Senna muncul dan menghancurkan roh-roh. Ichigo dan Rukia menghadapinya, tetapi dia menolak untuk menjawab pertanyaan dan pergi. Ichigo mengikuti Senna, sementara Rukia kembali ke Soul Society untuk mencari jawaban.
Sambil mengejar Senna, Ichigo bertemu duta-duta Soul Society yang ada di Bumi untuk menyelidiki refleksi misterius dunia manusia yang muncul di Soul Society. Mereka menemukan bahwa roh-roh yang terlihat sebelumnya adalah "Kosong", sekelompok jiwa amnesia yang hilang di ruang antara Soul Society dan dunia nyata, dan yang kenangannya bergabung membentuk satu kesatuan, "Shinenju". Di ruang di antara ini, roh-roh membentuk "Lembah Jeritan"; meskipun itu adalah fenomena alam, yang bertabrakan dengan dua dunia, yang tidak alami. Jadi mereka menyimpulkan seseorang melakukannya untuk mendapatkan Shinenju, dan para Penuai Jiwa berkumpul terpisah untuk menemukannya. Kemudian, Senna diserang oleh kelompok misterius dan Ichigo mengusir mereka, tanpa motif mereka.
Setelah Ichigo dan Senna menyatukan kembali dua jiwa yang hilang, beberapa perwira Soul Society dan beberapa angkatan bersenjata menyatakan bahwa Senna adalah Shinenju asli dan memerintahkan Ichigo untuk menyerahkannya, tetapi Ichigo menolak, menganggapnya sebagai makhluk. Kelompok misterius yang menyebut diri mereka "Orang Gelap", orang-orang buangan dari Soul Society yang mencari pembalasan untuk masa lalu, tiba dan menangkap Senna, sementara melawan para Penuai Jiwa. The Dark Ones membawa Senna ke Valley of Screams dan melampirkannya ke perangkat yang didukung oleh Blank yang dapat menyebabkan Lembah runtuh, menghasilkan tabrakan antara dunia nyata dan Soul Society yang akan menghancurkan keduanya.
Rukia pergi untuk mendapatkan bala bantuan dari Soul Society, tetapi kepala kapten mereka ingin menghancurkan Lembah sebelum runtuh dan menolak untuk memesan misi penyelamatan dengan hanya satu jam tersisa. Di Lembah, Ichigo gagal mengalahkan sejumlah besar Kosong dan Orang Kegelapan, tetapi dia diselamatkan oleh kedatangan rekan-rekannya di Soul Reaper. Sementara itu, kepala kapten yakin untuk memperpanjang penghancuran Lembah sehingga kekuatan Reaper Jiwa di sana dapat menyelesaikan misi dan melarikan diri dari Lembah sebelumnya. The Soul Reapers dengan cepat mengalahkan Dark Ones dan Blanks, sementara Ichigo mengalahkan pemimpin mereka, Ganryu. Kekuatan Soul Reaper kemudian dengan cepat meninggalkan portal Lembah dan kembali ke dunia nyata, konten dalam menyelesaikan misi.
Sambil mengejar Senna, Ichigo bertemu duta-duta Soul Society yang ada di Bumi untuk menyelidiki refleksi misterius dunia manusia yang muncul di Soul Society. Mereka menemukan bahwa roh-roh yang terlihat sebelumnya adalah "Kosong", sekelompok jiwa amnesia yang hilang di ruang antara Soul Society dan dunia nyata, dan yang kenangannya bergabung membentuk satu kesatuan, "Shinenju". Di ruang di antara ini, roh-roh membentuk "Lembah Jeritan"; meskipun itu adalah fenomena alam, yang bertabrakan dengan dua dunia, yang tidak alami. Jadi mereka menyimpulkan seseorang melakukannya untuk mendapatkan Shinenju, dan para Penuai Jiwa berkumpul terpisah untuk menemukannya. Kemudian, Senna diserang oleh kelompok misterius dan Ichigo mengusir mereka, tanpa motif mereka.
Setelah Ichigo dan Senna menyatukan kembali dua jiwa yang hilang, beberapa perwira Soul Society dan beberapa angkatan bersenjata menyatakan bahwa Senna adalah Shinenju asli dan memerintahkan Ichigo untuk menyerahkannya, tetapi Ichigo menolak, menganggapnya sebagai makhluk. Kelompok misterius yang menyebut diri mereka "Orang Gelap", orang-orang buangan dari Soul Society yang mencari pembalasan untuk masa lalu, tiba dan menangkap Senna, sementara melawan para Penuai Jiwa. The Dark Ones membawa Senna ke Valley of Screams dan melampirkannya ke perangkat yang didukung oleh Blank yang dapat menyebabkan Lembah runtuh, menghasilkan tabrakan antara dunia nyata dan Soul Society yang akan menghancurkan keduanya.
Rukia pergi untuk mendapatkan bala bantuan dari Soul Society, tetapi kepala kapten mereka ingin menghancurkan Lembah sebelum runtuh dan menolak untuk memesan misi penyelamatan dengan hanya satu jam tersisa. Di Lembah, Ichigo gagal mengalahkan sejumlah besar Kosong dan Orang Kegelapan, tetapi dia diselamatkan oleh kedatangan rekan-rekannya di Soul Reaper. Sementara itu, kepala kapten yakin untuk memperpanjang penghancuran Lembah sehingga kekuatan Reaper Jiwa di sana dapat menyelesaikan misi dan melarikan diri dari Lembah sebelumnya. The Soul Reapers dengan cepat mengalahkan Dark Ones dan Blanks, sementara Ichigo mengalahkan pemimpin mereka, Ganryu. Kekuatan Soul Reaper kemudian dengan cepat meninggalkan portal Lembah dan kembali ke dunia nyata, konten dalam menyelesaikan misi.
Namun, proses keruntuhan berlanjut, sebelum Senna mengorbankan dirinya untuk mendorong kedua dunia kembali terpisah. Setelah itu, ketika kedua dunia telah diselamatkan, Senna, dilemahkan oleh usahanya meminta Ichigo untuk membawanya ke kuburan agar dia bisa melihat namanya di batu nisannya, yang memiliki salah satu Kosong yang ingatannya Senna miliki; Ichigo berbohong dan mengatakan padanya bahwa namanya ada di situ. Percaya dia, dia mengungkapkan kepuasan bahwa dia pernah memiliki hidupnya sendiri sebelum memudar. Rukia mencatat bahwa sekali kekuatan Blank memudar, begitu juga semua kenangan tentang Senna. Setelah kredit, Ichigo berjalan di jembatan, melihat pita merah yang dia beli untuk Senna, mengambang dari langit dan melihat seorang gadis yang menyerupai dia berlari melewatinya. Dia dengan senang hati menyimpan memori mereka untuk dirinya sendiri.

